
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探索最终结果
调查的人员与探讨随冷冻箱期限段增长牛羊肉的密度、持水意识、配色、自由铁含磷量、ROS、脂质过腐蚀物、MDA、GSH和GPX4技术水平来评价指标肌肤机构癌组织的铁枯死状况。然而表现,冷冻箱期限段增长后,牛羊肉的密度在第5天和第6天偏态上升;持水意识降低;配色变深,消失质感,鲜红颜色转换成暗红颜色。前者,自由铁、抗逆性氧和MDA的含磷量偏态增强,癌组织凋亡率偏态增高。 科研人群去除多种冷藏库时间段的背部肌肉组织合格品的血清质,接下来展开SDS-PAGE剖析一下,血清质条带在多种期划分均衡且一样(图1a)。结合血清在多种合格品中的呈现状态,剖析一下看到相同的时间组合格品的中四位数更加接近于相同的时间技术水平(图1b),说明怎么写背部肌肉组织合格品血清质具备有优秀的组内一样性和组间差别的性。 高核高血清组学共司法检验出1996种高核高血清。以B0为比较组,需求B1、B2、B4和B6中的高核血清使用相互影响抒发分折,共司法检验到37七个DEPs。将火山图web3d,并结合FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05三个规定分折DEP。結果图甲1c-f如下,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别司法检验出22、33、73和140个DEPs,中间别调涨6、11、32和89个,下降16、22、41和54个。聚类分析形式开展了区别速冻事件段腿部肌肉组织开展组织开展中高核高血清的抒发,結果表明腿部肌肉组织开展高核血清抒发相互影响随着事件的推移吸收事件的加剧而加剧(图1g)。
图1| 与众不同冷冻箱时候的手臂肌肉土样核膳食纤维组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有异同保温时期的腿部肌肉试样异同核蛋白探讨(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁生亡球蛋白肽的PRM参考值介绍(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG丰度差异性表达方法核蛋白的铁阵亡机制化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT按量球高球蛋白组学工艺功能的,拜谱菌物已车辆研发成功并制定了建立健全完善的转录组学、球球蛋白组学、代谢转化组学或几组学结合车辆工艺功能的管理体系,欢迎致电咨询!
参照医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.