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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网站临床药理学阐释草酸钙肾结石防氧化应激性和真菌感染损害工作机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿体统软件最先见的皮肤疾病之1。肾团体中CaOx晶状体过饱和点积聚会得以从而导致肾小管神经细胞拉伤和凋亡,得以得以从而导致肾结石的导致。短链碳水化合物酸由肠子内活性污泥法菌发效伙食化学纤维出现,不仅仅在轮廓线肠子第一道防线中产生做用,另外在体统软件关卡上也产生重中之重做用。其中的,丁酸是最大量的短链碳水化合物酸,拥有免疫力限制和免疫力限制做用,本研究分析一起探讨丁酸对CaOx肾结石的做用名词解释未知靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山的医院泌尿五官科吴忠专家、周子健博士研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家教授、周子健博土在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了电脑网络临床药理学提供服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

优秀文章英文名称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 顾客公司:华山青岛博士整形医院医院 深入分析女朋友:大鼠、HK-2癌细胞 分成小组内容:相较比较组(Con)、3d模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱保证技术工艺:wifi网络药理学学查重

难点流量图

实验效果

探索工人率先创造出一个大鼠模特,利用生理变化血生化因素和组织结构病症学脱色等探索方法发觉丁酸能够降低CaOx模特大鼠肾CaOx硫化锌的形成了和受损,纠正CaOx模特大鼠的发炎受损和脱色物料的过于表达方法。不仅,丁酸还可促使草酸引导的HK-2细胞系系受损、脱色应激状态和细胞系系凋亡。 为探究性学习丁酸形式和靶人类人类遗传表观遗传组遗传遗传网路,研发员从PubChem读取丁酸和丁酸酯的二维和三维立体形式(图1A)。凭借PharmMapper数据表格资料源库和Uniprot数据表格资料源库处置后共淘汰出113个丁酸靶人类人类遗传表观遗传组遗传遗传供进一大步定性分折。将人类人类遗传表观遗传组遗传遗传详细完整信息倒入STRING数据表格资料源库,实行PPI网路定性分折。Cytoscape做出了编排的前20的联络线靶人类人类遗传表观遗传组遗传遗传的详细完整网路图,收录CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。此类联络线人类人类遗传表观遗传组遗传遗传与网路中的某个人类人类遗传表观遗传组遗传遗传均表演出一定的的对应性,表示此类人类人类遗传表观遗传组遗传遗传可以树立着信息化影响。GO和KEGG定性分折阐述了丁酸联络线人类人类遗传表观遗传组遗传遗传的对应方法和海洋分子生物工程学模块(图1C)。联络线人类人类遗传表观遗传组遗传遗传核心与类固醇的荷尔蒙回复、脱色应激性状态回复、渗透性氧肿瘤细胞对类固醇的荷尔蒙兴奋的生物工程学化学表现包括对强酸生物工程学有机化合物的生物工程学化学表现想关。综合上面的根据上述,此类联络线人类人类遗传表观遗传组遗传遗传核心参与活动了脱色应激性状态和对渗透性氧的海洋生物工程生物工程学化学表现时候,是肾结石造成制度中至关注重的方法,这反映出丁酸可以在肾结石中树立注重影响。

图1| 丁酸构成与靶基因遗传wifi网络概述(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部探索世界丁酸对CaOx肾结石或许切靶dna,科研人群使用GEO数据文件呈现库对GSE73680中正常参考与CaOx肾结石客户的dna的差异开始了科研。参考组与CaOx结石客户的明显性的差异理解dna(DEGs)检查准则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个dna发生了明显变换,这其中3379个(89.4%)dna理解调涨,404个(10.6%)dna理解上涨(图2A)。对DEGs开始聚类分析算法浅析,热图呈现了前10个被选中DEGs的二维分段聚类分析算法结构特征(图2B)。随着,科研人群可以通过GeneCards数据文件呈现库师签定了370个或者与CaOx肾结石有关于的dna,重要词排名前20位的分析dna试述有关于性評分下图2C图示。想要找回丁酸去治疗CaOx肾结石的重要靶点,科研人群将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于dna补救得以好几回个Venn图。终结,CYP2C9被设定为丁酸印象CaOx肾结石的隐性靶点(图2D)。不仅如此,科研人群还开始了丁酸与CYP2C9的原子核挂接,CYP2C9的4个氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸主动角色,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在充分利用线上药剂学学分析预测CYP2C9是丁酸引响CaOx肾结石的靶dna后,研究方案人数还经过血内部工作声明了CYP2C9可有效降低草酸诱导型的HK-2血内部的ROS含量、真菌感染受损和凋亡。

图2| 基本上据库合作探讨预測CYP2C9是丁酸用处于CaOx肾结石的靶DNA

探究但是

本探究1找到丁酸在自身和自身均能限制CaOx肾结石模特的防钝化应激性反应和真菌感染软组织神经破损,接着随后顺利经由wifi网络信息药剂学学学建立赢得丁酸导致CaOx肾结石的潜在性靶点——CYP2C9,最后一步顺利经由神经细胞膜实验英文确认CYP2C9在草酸盐引发的HK-2神经细胞膜ROS水平面、真菌感染软组织神经破损和凋亡。这个找到是因为丁酸或者顺利经由限制CYP2C9来限制CaOx肾结石的防钝化应激性反应,避免真菌感染软组织神经破损。这一个的时候中拜谱生态学学供给了wifi网络信息药剂学学学枝术性功能的,与此同时拜谱生态学学可提高了完美成熟的的什么是基因组学、高蛋白质组学、消化吸收组学等几组学设备及枝术性功能的,邀请致電咨询了解! 参看学术论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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