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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已屏幕上显示出很广的生物技术亲水性，分为抗癌症和抵抗疾病毒的功效。常见，三萜是可以通过甲羟戊酸路经自动合成的，并从大自然动植物和白色念珠菌中导入。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上刊发了发表文章“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的科研论文题目。该科研发现了三萜类氧化物野生虫草酸（GA）是能够液态物质养育的无柄野生虫草菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的微怪物转变成生产的。用转录组和蛋清质组学枝术进步骤深入研究无柄虫草菌丝体中DHT生产多种虫草酸（GA）的规则，并结合多个学枝术监测到的不一致性基因组和不一致性蛋清，推算DHT 微怪物组成 GA 的途经。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录成分析和工作种类

利用对无柄野生灵芝念珠菌菌丝体参与转录组测序共得出67230个转录本和14297个单dna。在这么多单dna中，491个被监定为地域差异表现dna（DEGs），另外213个表现上浮，279个表现再降（图1A）。GO含有概述后，DEGs分成怪物时中（BP）、血体细胞部分（CC）和原子能力（MF）3类。在BP专业品类中，会出现了前两个子专业品类：四环素溶解分泌时中，醋酸钠盐分泌时中和甲酸盐分泌时中;而在CC专业品类中，血体细胞外区、突触符合体、突触的结构是前两个亚类。谈谈MF专业品类，甲酸脱氢酶（NAD）特异性、氧化反应还原系统酶特异性和酸氨（或酰胺）联接酶特异性是前两个亚专业品类（图1B）。在DEGs的KEGG径路概述中，前30条含有度比较高的径路有27条应属于分泌，另外甲烷气体分泌、乙醛酸盐和二羧酸盐分泌、丙酸盐分泌无线信号径路相关系数含有（图1D）。

图1|转录成分析和基本功能分类别

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

确认对无柄野生灵芝白色念珠菌菌丝体做好血清质组学了解，共计判定了16,457种特色肽、2606种血清质和2588种化学发光法血清质。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的选择必要条件下，在那2606种血清质中，94种被签别为一定的对比展现血清（DEPs），里面的52种调涨，42种变动（图2A），图2C屏幕上信息信息显示了一定的对比展现血清的聚类剖析了解热图。从GO了解去看，BP分类屏幕上信息信息显示，通常数DEPs参入冰醋酸盐分泌工作、抗生素类实施分解掉分泌工作和口服药实施分解掉分泌工作。CC类DEPs在内部膜外区、过硫化物酶体和微体中覆盖率是很高的，硫化还原成酶化学活化和甲酸脱氢酶（NAD）化学活化在MF类中DEPs的百分比是很高的（图2B）。与转录组结论相近，KEGG径路了解屏幕上信息信息显示，更多DEPs在分泌中丰度，里面的3条最丰度的途经是光合海洋动物中的碳实施固定、碳分泌和MAPK数字信号径路（图2D）。不仅如此，确认了解GO的服务器的CC对DEPs做好亚内部膜产品定位了解和参考文献标注（图2E），DEPs通常规划在内部膜质（40.66%）、内部膜膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），原理上是GAs海洋动物人工的通常定位。

图2|蛋白酶质组的降钙素原检测浅析和作用检验

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

糊口物转换成和剖析组侯选人DEGs和DEPs加工制作了维恩图，有20个距离抒发染色体遗传（图3A）。对转录组和蛋清质组中E组和C组公有的DEGs/DEPs做聚类探讨探讨，发觉mRNA和蛋清质之中有1几个上涨染色体遗传和几个上涨染色体遗传，DEGs与其说翻意的DEPs抒发标准呈正一些，依托于Pearson的一些常数探讨，在转录组和蛋清质组之中查重到比较高的一些性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）的检测成果凸显，E组和C组17个DEGs的呈现含量地域差异不错，这之中9个为上浮DEGs，8个为变动DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的呈现发展与转录混合物析成果不一样。

图3|淀粉酶质组的定量定性分析定性分析和效果认证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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